Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV3

SLC5A7, High affinity choline transporter 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A7Q9GZV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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