Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM54Q9BYV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM54Q9BYV2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM54Q9BYV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM54Q9BYV2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM54Q9BYV2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM54Q9BYV2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM54Q9BYV2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM54Q9BYV2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM54Q9BYV2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms