Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf50Q9BV19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf50Q9BV19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf50Q9BV19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.9 ms