Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSRP1Q9BUV0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSRP1Q9BUV0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSRP1Q9BUV0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms