Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM79Q9BSE2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM79Q9BSE2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM79Q9BSE2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM79Q9BSE2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms