Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM56Q9BRZ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM56Q9BRZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM56Q9BRZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM56Q9BRZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms