Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMB7Q99436 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMB7Q99436 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMB7Q99436 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMB7Q99436 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMB7Q99436 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PSMB7Q99436 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMB7Q99436 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMB7Q99436 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMB7Q99436 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMB7Q99436 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMB7Q99436 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSMB7Q99436 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSMB7Q99436 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSMB7Q99436 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMB7Q99436 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMB7Q99436 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB7Q99436 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMB7Q99436 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMB7Q99436 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMB7Q99436 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMB7Q99436 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMB7Q99436 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMB7Q99436 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMB7Q99436 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMB7Q99436 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms