Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT15Q96T59 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDRT15Q96T59 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDRT15Q96T59 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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