Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BBS4Q96RK4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS4Q96RK4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS4Q96RK4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS4Q96RK4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms