Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CICQ96RK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CICQ96RK0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CICQ96RK0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CICQ96RK0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CICQ96RK0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CICQ96RK0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CICQ96RK0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CICQ96RK0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CICQ96RK0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CICQ96RK0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CICQ96RK0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CICQ96RK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CICQ96RK0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CICQ96RK0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CICQ96RK0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms