Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNT1Q96Q11 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNT1Q96Q11 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRNT1Q96Q11 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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