Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCMTD1Q96MG8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCMTD1Q96MG8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCMTD1Q96MG8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCMTD1Q96MG8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCMTD1Q96MG8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms