Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCZQ96LD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCZQ96LD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCZQ96LD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms