Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP36Q96G28 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP36Q96G28 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP36Q96G28 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP36Q96G28 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP36Q96G28 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms