Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF18Q96CE8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF18Q96CE8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF18Q96CE8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF18Q96CE8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF18Q96CE8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF18Q96CE8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF18Q96CE8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM4SF18Q96CE8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms