Protein–RNA interactions for Protein: Q96A37

RNF166, RING finger protein 166, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF166Q96A37 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF166Q96A37 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF166Q96A37 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF166Q96A37 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF166Q96A37 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms