Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD47

RPS4Y2, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y2Q8TD47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS4Y2Q8TD47 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y2Q8TD47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4Y2Q8TD47 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4Y2Q8TD47 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4Y2Q8TD47 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4Y2Q8TD47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms