Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PATJQ8NI35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PATJQ8NI35 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PATJQ8NI35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PATJQ8NI35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PATJQ8NI35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PATJQ8NI35 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PATJQ8NI35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PATJQ8NI35 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms