Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS2

GOT1L1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1L1Q8NHS2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOT1L1Q8NHS2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1L1Q8NHS2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1L1Q8NHS2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms