Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD9Q8NE22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD9Q8NE22 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD9Q8NE22 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms