Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC43A2Q8N370 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC43A2Q8N370 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC43A2Q8N370 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A2Q8N370 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms