Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00523Q86TU6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00523Q86TU6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00523Q86TU6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms