Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5W3

BCDIN3D, Pre-miRNA 5'-monophosphate methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCDIN3DQ7Z5W3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCDIN3DQ7Z5W3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCDIN3DQ7Z5W3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCDIN3DQ7Z5W3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCDIN3DQ7Z5W3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BCDIN3DQ7Z5W3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCDIN3DQ7Z5W3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCDIN3DQ7Z5W3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BCDIN3DQ7Z5W3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BCDIN3DQ7Z5W3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCDIN3DQ7Z5W3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCDIN3DQ7Z5W3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms