Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETXQ7Z333 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SETXQ7Z333 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETXQ7Z333 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETXQ7Z333 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms