Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms