Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYPD4Q6UWN0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD4Q6UWN0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYPD4Q6UWN0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms