Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2Q6PL18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2Q6PL18 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATAD2Q6PL18 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ATAD2Q6PL18 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATAD2Q6PL18 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATAD2Q6PL18 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ATAD2Q6PL18 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms