Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NANOGP8Q6NSW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NANOGP8Q6NSW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGP8Q6NSW7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGP8Q6NSW7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NANOGP8Q6NSW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms