Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL6Q6ICC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL6Q6ICC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL6Q6ICC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms