Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX4IPQ5VYV7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms