Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFDP3Q5H9I0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFDP3Q5H9I0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFDP3Q5H9I0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFDP3Q5H9I0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TFDP3Q5H9I0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms