Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC38Q502W7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC38Q502W7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC38Q502W7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC38Q502W7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms