Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
KHDC1Q4VXA5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KHDC1Q4VXA5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KHDC1Q4VXA5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KHDC1Q4VXA5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms