Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM12Q3MHD2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM12Q3MHD2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM12Q3MHD2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms