Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX4Q33E94 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX4Q33E94 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX4Q33E94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms