Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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