Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPTX1Q15818 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPTX1Q15818 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX1Q15818 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms