Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

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Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP11Q15643 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIP11Q15643 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIP11Q15643 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIP11Q15643 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
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