Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPRIN1Q14444 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPRIN1Q14444 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPRIN1Q14444 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN1Q14444 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms