Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSHL1Q14406 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CSHL1Q14406 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSHL1Q14406 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSHL1Q14406 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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