Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDZK1IP1Q13113 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDZK1IP1Q13113 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1IP1Q13113 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1IP1Q13113 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms