Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAF1Q13077 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
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TRAF1Q13077 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAF1Q13077 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
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TRAF1Q13077 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAF1Q13077 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
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TRAF1Q13077 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAF1Q13077 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
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