Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX2Q02962 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX2Q02962 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAX2Q02962 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX2Q02962 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAX2Q02962 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAX2Q02962 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX2Q02962 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX2Q02962 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX2Q02962 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAX2Q02962 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAX2Q02962 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAX2Q02962 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAX2Q02962 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX2Q02962 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX2Q02962 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAX2Q02962 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAX2Q02962 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAX2Q02962 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAX2Q02962 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX2Q02962 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX2Q02962 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX2Q02962 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAX2Q02962 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX2Q02962 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms