Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1CAP62136 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1CAP62136 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1CAP62136 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP1CAP62136 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms