Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTENP60484 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTENP60484 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTENP60484 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTENP60484 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTENP60484 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTENP60484 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTENP60484 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTENP60484 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTENP60484 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTENP60484 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTENP60484 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTENP60484 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTENP60484 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTENP60484 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTENP60484 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTENP60484 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTENP60484 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTENP60484 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTENP60484 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTENP60484 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTENP60484 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTENP60484 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTENP60484 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTENP60484 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTENP60484 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTENP60484 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTENP60484 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTENP60484 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTENP60484 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTENP60484 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTENP60484 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTENP60484 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTENP60484 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTENP60484 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTENP60484 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTENP60484 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTENP60484 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTENP60484 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTENP60484 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTENP60484 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTENP60484 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTENP60484 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTENP60484 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTENP60484 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTENP60484 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTENP60484 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTENP60484 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTENP60484 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTENP60484 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTENP60484 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTENP60484 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTENP60484 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTENP60484 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTENP60484 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTENP60484 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTENP60484 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTENP60484 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTENP60484 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTENP60484 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTENP60484 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTENP60484 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTENP60484 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTENP60484 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTENP60484 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTENP60484 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTENP60484 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTENP60484 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTENP60484 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTENP60484 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTENP60484 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTENP60484 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTENP60484 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTENP60484 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTENP60484 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTENP60484 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTENP60484 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTENP60484 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTENP60484 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTENP60484 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTENP60484 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTENP60484 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTENP60484 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTENP60484 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 641.6 ms