Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5EP56381 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5EP56381 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5EP56381 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5EP56381 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5EP56381 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5EP56381 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5EP56381 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5EP56381 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5EP56381 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms