Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC3P53804 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC3P53804 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC3P53804 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC3P53804 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC3P53804 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC3P53804 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC3P53804 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC3P53804 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC3P53804 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC3P53804 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC3P53804 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC3P53804 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC3P53804 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC3P53804 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC3P53804 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC3P53804 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC3P53804 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC3P53804 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC3P53804 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC3P53804 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC3P53804 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC3P53804 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC3P53804 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC3P53804 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC3P53804 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC3P53804 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC3P53804 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC3P53804 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC3P53804 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC3P53804 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC3P53804 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC3P53804 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC3P53804 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC3P53804 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC3P53804 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC3P53804 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC3P53804 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC3P53804 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTC3P53804 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTC3P53804 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC3P53804 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC3P53804 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC3P53804 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC3P53804 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC3P53804 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC3P53804 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC3P53804 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC3P53804 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC3P53804 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC3P53804 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC3P53804 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC3P53804 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC3P53804 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC3P53804 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC3P53804 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC3P53804 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC3P53804 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC3P53804 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC3P53804 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC3P53804 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC3P53804 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC3P53804 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC3P53804 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC3P53804 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC3P53804 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC3P53804 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC3P53804 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC3P53804 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC3P53804 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC3P53804 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC3P53804 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC3P53804 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC3P53804 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC3P53804 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC3P53804 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC3P53804 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC3P53804 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC3P53804 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC3P53804 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC3P53804 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC3P53804 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC3P53804 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC3P53804 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC3P53804 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC3P53804 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC3P53804 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC3P53804 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC3P53804 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC3P53804 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC3P53804 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC3P53804 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms