Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNBP48739 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PITPNBP48739 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITPNBP48739 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PITPNBP48739 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms