Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EIF4A3P38919 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF4A3P38919 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4A3P38919 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1037.7 ms