Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT9P35527 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT9P35527 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT9P35527 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT9P35527 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT9P35527 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT9P35527 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT9P35527 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT9P35527 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT9P35527 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT9P35527 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT9P35527 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT9P35527 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT9P35527 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT9P35527 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT9P35527 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT9P35527 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT9P35527 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT9P35527 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT9P35527 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT9P35527 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT9P35527 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT9P35527 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT9P35527 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT9P35527 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT9P35527 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT9P35527 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT9P35527 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT9P35527 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT9P35527 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT9P35527 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT9P35527 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT9P35527 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT9P35527 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT9P35527 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT9P35527 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT9P35527 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT9P35527 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT9P35527 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT9P35527 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT9P35527 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT9P35527 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT9P35527 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT9P35527 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT9P35527 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT9P35527 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT9P35527 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KRT9P35527 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT9P35527 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT9P35527 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT9P35527 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT9P35527 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT9P35527 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT9P35527 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT9P35527 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT9P35527 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT9P35527 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT9P35527 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT9P35527 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT9P35527 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT9P35527 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT9P35527 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT9P35527 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT9P35527 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT9P35527 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT9P35527 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT9P35527 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT9P35527 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT9P35527 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT9P35527 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT9P35527 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT9P35527 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT9P35527 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT9P35527 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT9P35527 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT9P35527 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KRT9P35527 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT9P35527 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT9P35527 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT9P35527 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT9P35527 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT9P35527 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT9P35527 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT9P35527 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT9P35527 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT9P35527 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT9P35527 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT9P35527 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT9P35527 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT9P35527 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT9P35527 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT9P35527 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT9P35527 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT9P35527 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT9P35527 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT9P35527 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT9P35527 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT9P35527 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT9P35527 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT9P35527 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms